這個月我們采訪了明尼蘇達州州立大學藥物設計中心副教授Dr. Christine Salomon。
Dr. Salomon專注于化學與微生物生態學交叉領域,尋找具有長遠開發應用潛力的新發現代謝產物。當花費大量經歷研究地球表面生物,我們對地底下的生物世界卻知之甚少。Dr. Salomon調查研究了位于明尼蘇達州北邊的蘇丹礦山深入地下半英里的神秘微生物群。蘇丹礦山這個廢棄的鐵礦,已經劃入了明尼蘇達州州立公園,成為新的待開發研究資源。
問:蘇丹礦山下的微生物生態與其它地下洞穴有什么不同?
答:當礦山還開采的時候,礦工就打了大量的探孔尋找更多的鐵礦。隨著時間推移,地下水從周圍巖石通過探孔滲透到礦洞中,形成富鐵鹵水。進入礦洞后開始接觸含氧空氣并混入大量氯化鈣。前期采樣做微生物多樣性分析發現大量放線菌基因。而這種革蘭氏陽性菌正是生產多種抗生素和更多有趣物質的來源。
問:你們的實驗室對這些微生物群落做了怎樣的調查?
答:去年夏天我們收到LCCMR 從環境與自然資源信托基金的撥款,培養從礦洞中收集到的樣品,并從這些菌株中發現了一些新的代謝產物。有趣的是,蘇丹礦山發現的大量放線菌種類非常接近于海底泥微生物。同時也發現這些微生物能夠生產出一些獨一無二的抗真菌組分。
問:做這些工作的意義有哪些?下一步有什么計劃?
答:目前一線理想的抗真菌感染藥物種類非常有限,所以尋找新的抗真菌組分變得非常熱門。我們對這些新穎的代謝產物非常感興趣,希望開發出可用于人類疾病治療的產品。同時,我們對蘇丹礦山中真菌與細菌之間的化學生態關系也非常感興趣。正與一位真菌微生物學家合作,準備再次進洞收集真菌樣品,研究其在礦洞環境下與其它微生物之間的微妙共生關系中扮演的角色。
問:Mo BIO的產品如何助力你的工作?
答:我們使用PowerSoil Kit來提取樣品微生物DNA并建立克隆庫。也用了BiOstic Bacteremia kit提取培養的放線菌DNA。試劑盒自帶的研磨珠裂解革蘭氏陽性菌非常高效,相對于傳統基因組DNA提取方法節省了大量處理時間。